上海市公共衛(wèi)生臨床中心盧洪洲教授與轉化醫(yī)學國家重大科技基礎設施（上海）陳賽娟院士領銜的聯(lián)合攻關團隊，對上海市公共衛(wèi)生臨床中心在2020年1月20日至2月25日期間收治的326例新型冠狀病毒肺炎病人的臨床癥狀、免疫檢測、病毒學數(shù)據(jù)進行全面深度分析后發(fā)現(xiàn)，自2019年年底到今年年初，病原體可能已較為廣泛地存在人群中。在疫情發(fā)生時華南海鮮市場并非最初的發(fā)生地，病原體很可能在更早的時候從共同的祖先的多個分支獨立傳播擴散，最終形成這次暴發(fā)。5月20日，《自然》雜志在線發(fā)表了該項研究成果。
研究團隊高質量完成了112例新冠病毒基因組測序、組裝和解析。從病毒基因組序列的進化樹分析發(fā)現(xiàn)，新冠病毒主要有Clade I和Clade II兩個分支。經(jīng)研究確認，有華南海鮮市場接觸史的6名患者均集中在Clade I分枝上，而Clade II患者則無該接觸史。此結果提示，新冠肺炎疫情的發(fā)生并不局限于華南海鮮市場。
之后，研究團隊通過對疫情暴發(fā)的不同時間階段和不同區(qū)域患者的新冠病毒基因序列（截至2020年3月初）變異特征進行比較分析，從上海病例分離的病毒基因組中識別了169個堿基改變，其重復出現(xiàn)的突變與已公布的病毒序列一致，呈現(xiàn)較為穩(wěn)定的進化過程。該結果提示，新冠病毒可能在疫情早期就已適應在人類宿主中傳播。
研究團隊還發(fā)現(xiàn)，新冠病毒肺炎患者淋巴細胞明顯減少，尤其是重癥患者CD4+和CD8+ T淋巴細胞減少最為明顯，淋巴細胞下降水平與疾病嚴重程度息息相關，且重癥患者與炎性細胞因子血清白介素（IL-6和IL-8）水平明顯升高有密切聯(lián)系。這表明，新冠病毒肺炎疾病嚴重程度主要與患者年齡、基礎疾病及淋巴細胞減少和相關的細胞因子風暴密切相關。依據(jù)上述臨床資料分析采取早期針對性干預措施，將有助于阻止疾病的進展。
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