上海市公共衛(wèi)生臨床中心盧洪洲教授與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)國(guó)家重大科技基礎(chǔ)設(shè)施（上海）陳賽娟院士領(lǐng)銜的聯(lián)合攻關(guān)團(tuán)隊(duì)，對(duì)上海市公共衛(wèi)生臨床中心在2020年1月20日至2月25日期間收治的326例新型冠狀病毒肺炎病人的臨床癥狀、免疫檢測(cè)、病毒學(xué)數(shù)據(jù)進(jìn)行全面深度分析后發(fā)現(xiàn)，自2019年年底到今年年初，病原體可能已較為廣泛地存在人群中。在疫情發(fā)生時(shí)華南海鮮市場(chǎng)并非最初的發(fā)生地，病原體很可能在更早的時(shí)候從共同的祖先的多個(gè)分支獨(dú)立傳播擴(kuò)散，最終形成這次暴發(fā)。5月20日，《自然》雜志在線發(fā)表了該項(xiàng)研究成果。

研究團(tuán)隊(duì)高質(zhì)量完成了112例新冠病毒基因組測(cè)序、組裝和解析。從病毒基因組序列的進(jìn)化樹分析發(fā)現(xiàn)，新冠病毒主要有Clade I和Clade II兩個(gè)分支。經(jīng)研究確認(rèn)，有華南海鮮市場(chǎng)接觸史的6名患者均集中在Clade I分枝上，而Clade II患者則無該接觸史。此結(jié)果提示，新冠肺炎疫情的發(fā)生并不局限于華南海鮮市場(chǎng)。

之后，研究團(tuán)隊(duì)通過對(duì)疫情暴發(fā)的不同時(shí)間階段和不同區(qū)域患者的新冠病毒基因序列（截至2020年3月初）變異特征進(jìn)行比較分析，從上海病例分離的病毒基因組中識(shí)別了169個(gè)堿基改變，其重復(fù)出現(xiàn)的突變與已公布的病毒序列一致，呈現(xiàn)較為穩(wěn)定的進(jìn)化過程。該結(jié)果提示，新冠病毒可能在疫情早期就已適應(yīng)在人類宿主中傳播。

研究團(tuán)隊(duì)還發(fā)現(xiàn)，新冠病毒肺炎患者淋巴細(xì)胞明顯減少，尤其是重癥患者CD4+和CD8+ T淋巴細(xì)胞減少最為明顯，淋巴細(xì)胞下降水平與疾病嚴(yán)重程度息息相關(guān)，且重癥患者與炎性細(xì)胞因子血清白介素（IL-6和IL-8）水平明顯升高有密切聯(lián)系。這表明，新冠病毒肺炎疾病嚴(yán)重程度主要與患者年齡、基礎(chǔ)疾病及淋巴細(xì)胞減少和相關(guān)的細(xì)胞因子風(fēng)暴密切相關(guān)。依據(jù)上述臨床資料分析采取早期針對(duì)性干預(yù)措施，將有助于阻止疾病的進(jìn)展。